Desa Ponjong sejak berdirinya telah melakukan pergantian Kepala Desa Berikut Kepala Desa (Lurah) dari yang pertama sampai sekarang
- Iro Taruno (1912)
- Purwo Atmodjo
- Harjo Atmodjo
- Pawiro Yahyo (1946-1949)
- Pawiro Suwito (1949-1965)
- Muhammad Syahidi (1965-1992)
- Sugiyono (1992-2004)
- Hasyim (2004-2015)
- Arif Al Fauzi (2015-Sekarang)
Untuk Pejabat Pemerintahan Desa Ponjong 2018-Sekarang
Sekretaris Desa: Wakhid Aryanto
Kepala Bagian Pemerintahan: Budiman Setyanugroho
Staf Bagian Pemerintah: Ikhsan Dwi Nanda
Kepala Bagian Pembangunan: Parja
Kepala Bagian Kesejahteraan Rakyat: Muhammad Taufiq Hidayat, S. Si
Kepala Urusan Keuangan: Doni Aries Tyanto
Kepala Urusan Perencanaan: Puji Astuti
Kepala Urusan Umum: Ahmad Suryono
Staf Kabag. Pembangunan: Aris
Untuk Pejabat Pemerintahan Desa Ponjong 2015-2018
Sekretaris Desa: Eko Nur Bambang Wacana
Kepala Bagian Pemerintahan: Budiman Setyanugroho
Staf Bagian Pemerintah: Ikhsan Dwi Nanda
Kepala Bagian Pembangunan: Parja
Kepala Bagian Kesejahteraan Rakyat: PJ. Ahmad Suryono
Staf Bagian Kesejahteraan Rakya: Aprilia Wati
Kepala Urusan Keuangan: PJ. Ahmad Suryono
Kepala Urusan Perencanaan: Puji Astuti
Kepala Urusan Umum: Ahmad Suryono
Staf Kabag. Pembangunan: Aris
Untuk Pejabat Pemerintahan Desa Ponjong 2004-2015
Sekretaris Desa: Eko Nur Bambang Wacana
Kepala Bagian Pemerintahan: Budiman Setyanugroho
Staf Bagian Pemerintah: Ikhsan Dwi Nanda
Kepala Bagian Pembangunan: Parja
Kepala Bagian Kesejahteraan Rakyat: Jahidi
Staf Bagian Kesejahteraan Rakya: Aprilia Wati
Kepala Urusan Keuangan: Tukiman
Kepala Urusan Perencanaan: Puji Astuti
Kepala Urusan Umum: Ahmad Suryono
Staf Kabag. Pembangunan: Aris
Dukuh Dukuh di Desa Ponjong
- Dukuh Karangijo Kulon: Basuki
- Dukuh Karangijo Wetan:
SugiyoOktarina Fajar Kurniawati - Dukuh Sumber Lor: Sutino
- Dukuh Sumber Kidul:
Doni Aries TyantoMuhammad Mafud
- Dukuh Ponjong: Ratiman
- Dukuh Duren: Waluyo
- Dukuh Kuwon: Sukatno
- Dukuh Serut: Saparti
- Dukuh Jaten: Tumiyo
- Dukuh Tembesi: Purwanti
- Dukuh Padangan: Sigit Supriyanto